На практике многие так и делают. Водитель подтверждает погрузку и выгрузку в приложении оператора (ПЭП) или подписывает через Госключ либо NFC-Рутокен. Логист или руководитель подписывает с компьютера или тоже через Госключ. У операторов подписание с телефона полностью рабочее, но для этого должны сойтись три условия:
- подключено подписание ЭТрН через Госключ;
- в Госключе выпущена подпись;
- если вы подписываете не как руководитель, загружена ваша МЧД.
Судя по вашему предыдущему сообщению про окно «нет доступных сертификатов», у вас не выполнено одно из них. Проверьте по инструкции своего оператора. Если всё настроено, а окно остаётся, обратитесь в его поддержку.